Isla Iguana se encuentra ubicada en el Océano Pacífico, a los 7o37’06” de latitud norte y 80o00’00” de longitud oeste, en el extremo sur oriental de la Península de Azuero, a unos 5 km de las playas de Mariabé, Distrito de Pedasí, Provincia de Los Santos, República de Panamá.